## Description

TEST TRACK ONLY

This track shows the number of 5' CAGE tags mapped to the genome on the plus and minus strands. At each base in the genome, the count is the number of CAGE tags that overlap at this base.

## Methods

CAGE tags are sequenced 5' ends of full length cDNA (using RIKEN fl cDNA technology). Mapping methodology will be described in upcoming publications

## Verification

Verification will be described in upcoming publications

## Credits

The FANTOM Consortium, Riken Genome Science Laboratory and Riken Genome Exploration Research Group (Genome Network Project Core Group) FANTOM Consortium: P. Carninci, T. Kasukawa, S. Katayama, Gough, M. Frith, N. Maeda, R. Oyama, T. Ravasi, B. Lenhard, C. Wells, R. Kodzius, K. Shimokawa, V. B. Bajic, S. E. Brenner, S. Batalov, A. R. R. Forrest, M. Zavolan, M. J. Davis, L. G. Wilming, V. Aidinis, J. Allen, A. Ambesi-Impiombato, R. Apweiler, R. N. Aturaliya, T. L. Bailey, M. Bansal, K. W. Beisel, T. Bersano, H. Bono, A. M. Chalk, K. P. Chiu, V. Choudhary, A. Christoffels, D. R. Clutterbuck, M. L. Crowe, E. Dalla, B. P. Dalrymple, B. de Bono, G. Della Gatta, D. di Bernardo, T. Down, P. Engstrom, M. Fagiolini, G. Faulkner, C. F. Fletcher, T. Fukushima, M. Furuno, S. Futaki, M. Gariboldi, P. Georgii-Hemming, T. R. Gingeras, T. Gojobori, R. E. Green, S. Gustincich, M. Harbers, V. Harokopos, Y. Hayashi, S. Henning, T. K. Hensch, N. Hirokawa, D. Hill, L. Huminiecki, M. Iacono, K. Ikeo, A. Iwama, T. Ishikawa, M. Jakt, A. Kanapin, M. Katoh, Y. Kawasawa, J. Kelso, H. Kitamura, H. Kitano, G. Kollias, S. P. T. Krishnan, A.F. Kruger, S.K. Kummerfeld, I. V. Kurochkin, L. F. Lareau, L. Lipovich, J. Liu, S. Liuni, S. McWilliam, M. Madan Babu, M. Madera, L. Marchionni, H. Matsuda, S. Matsuzawa, H. Miki, F. Mignone, S. Miyake, K. Morris, S. Mottagui-Tabar, N. Mulder, N. Nakano, H. Nakauchi, P. Ng, R. Nilsson, S. Nishiguchi, S. Nishikawa, F. Nori, O. Ohara, Y. Okazaki, V. Orlando, K. C. Pang, W. J. Pavan, G. Pavesi, G. Pesole, N. Petrovsky, S. Piazza, W. Qu, J. Reed, J. F. Reid, B. Z. Ring, M. Ringwald, B. Rost, Y. Ruan, S. Salzberg, A. Sandelin, C. Schneider, C. Sch.ANvnbach, K. Sekiguchi, C. A. M. Semple, S. Seno, L. Sessa, Y. Sheng, Y. Shibata, H. Shimada, K. Shimada, B. Sinclair, S. Sperling, E. Stupka, K. Sugiura, R. Sultana, Y. Takenaka, K. Taki, K. Tammoja, S. L. Tan, S. Tang, M. S. Taylor, J. Tegner, S. A. Teichmann, H. R. Ueda, E. van Nimwegene, R. Verardo, C. L. Wei, K. Yagi, H. Yamanishi, E. Zabarovsky, S. Zhu, A. Zimmer, W. Hide, C. Bult, S. M. Grimmond, R. D. Teasdale, E. T. Liu, V. Brusic, J. Quackenbush, C. Wahlestedt, J. Mattick, D. Hume. RIKEN Genome Exploration Research Group: C. Kai, D. Sasaki, Y. Tomaru, S. Fukuda, M. Kanamori-Katayama, M. Suzuki, J. Aoki, T. Arakawa, J. Iida, K. Imamura, M. Itoh, T. Kato, H. Kawaji, N. Kawagashira, T. Kawashima, M. Kojima, S. Kondo, H. Konno, K. Nakano, N. Ninomiya, T. Nishio, M. Okada, C. Plessy, K. Shibata, T. Shiraki, S. Suzuki, M. Tagami, K Waki, A. Watahiki, Y. Okamura-Oho, H. Suzuki, J. Kawai, General Organizer: Y. Hayashizaki

## References

Cap analysis gene expression for high-throughput analysis of transcriptional starting point and identification of promoter usage. Shiraki T, Kondo S, Katayama S, Waki K, Kasukawa T, Kawaji H, Kodzius R, Watahiki A, Nakamura M, Arakawa T, Fukuda S, Sasaki D, Podhajska A, Harbers M, Kawai J, Carninci P, Hayashizaki Y. Proc Natl Acad Sci U S A. 2003 Dec 23;100(26):15776-81