#RUN_TIME Thu Aug 28 00:51:44 2008
#SOFTWARE_VERSION @(#) $Id: qualityFilter.pl,v 1.8 2007/11/26 14:42:26 tc Exp $
#FILTER_CRITERION ((CHASTITY>=0.6))
TTAGAAATGTCCACTGCAGGACGTGG 11953 5
GAAAACTTAAAAAGGTGTTAAATTTT 0 0
GTTTTTTAGTGATTTCGTCATTTTTC 13000 3
TGACTGTTGGATTTATATTATTTCTT 13000 1 mmu_ref_1_37:179764953 F TGACTGTTGGATTTATATTATTTCTT 10906
TACATATACACATACACATACATATA 13000 56
GTGTTTTTCAGTGTAACTCACTCATC 13000 10
TAGATGCTAAATATCCCCCTCAAAGT 0 0
GATAAAAGTTTGATACACTTTAGACA 13000 1 mmu_ref_5_37:88334169 R TGTCTAAAGTGTATCAAACTTTTATC 9859
TGAGGGGTATGACTGAATATCTTCAG 13000 14
AATGGGTTCACAGGCAGATCGAGCCG 13000 1 mmu_ref_4_37:41300066 F AATGGGTTCACAGGCAGATCGAGCCG 9859
GGAAAATTTAGAAATGTCCACTGTAG 13000 50
GACTTGAAGTTATTATCATATAGATC 13000 4
GTATTTCACTTCCTTAAGTGTGTATA 0 0
GAGAAATAACAAAACTAACAGACATT 13000 2
GCTGTAACTCCCTCTATTAAGAATCT 13000 1 mmu_ref_6_37:12143858 R AGATTCTTAATAGAGGGAGTTACAGC 9859
GTCAGTTCTCTCCTTCCTCCATACAG 13000 1 mmu_ref_7_37:17322027 F GTCAGTTCTCTCCTTCCTCCATACAG 11953
GTGGCACACAGAACCTATAACCCTCA 13000 1 mmu_ref_16_37:41376291 R TGAGGGTTATAGGTTCTGTGTGCCAC 9859
TTTCTCCAATAGGGTCATACCTCATA 13000 1 mmu_ref_12_37:27398329 R TATGAGGTATGACCCTATTGGAGAAA 10906
TTCCTACAAAGTTTTAATTTTAAATT 13000 1 mmu_ref_3_37:14092109 R AATTTAAAATTAAAACTTTGTAGGAA 9859
GAATGATTGGTGTGATAAATAATGTT 13000 1 mmu_ref_1_37:116730648 R AACATTATTTATCACACCAATCATTC 9859
GAAGCAGACTTTTTAATTTTTTACTA 13000 1 mmu_ref_1_37:97868632 F GAAGCAGACTTTTTAATTTTTTACTA 10906
GTAGGACATGGAATATGCCAAGAAAA 11953 71
GGTAATTCACAGTTTGAAATGAAGCA 13000 1 mmu_ref_X_37:66984760 F GGTAATTCACAGTTTGAAATGAAGCA 9859
GCCTCAACAGAAACAAAAATATTGAA 13000 37
TGCTAACAGGTACTCATGGCACAGAT 11953 1 mmu_ref_3_37:22679356 F TGCTAACAGGTACTCATGGCACAGAA 9859
GAAAATTTAGAAATGTCCAATGTAGG 11953 66
GGGGTTGGTCTGGTGTTGCTCTGTAT 13000 1 mmu_ref_18_37:57492171 F GGGGTTGGTCTGGTGTTGCTCTGTAT 11953
GAGAATGCTCGCCTTTTATATAATGT 13000 1 mmu_ref_4_37:116267591 F GAGAATGCTCGCCTTTTATATAATGT 9859
TGTGCATTTCTCATTTTTCACGTTTT 13000 93
TTGACTTCTTCCTTTCAAATTGTATC 13000 3
GAGGGAATTAGTGAAAGGAATGAATA 13000 1 mmu_ref_1_37:154720925 F GAGGGAATTAGTGAAAGGAATGAATA 9859
GATTTTCAGTTTTCTCGCCATATTTT 10906 57
GTTTTCTCGCCATATTCCAGGTCCTT 13000 1 mmu_ref_2_37:98507289 R AAGGACCTGGAATATGGCGAGAAAAC 11953
GTATATAATTAGTATGCCATGTTTTT 13000 1 mmu_ref_12_37:62103751 F GTATATAATTAGTATGCCATGTTTTT 9859
GTCAAATAAATGCAAAGTCCTTCAAG 13000 1 mmu_ref_12_37:94072062 F GTCAAATAAATGCAAAGTCCTTCAAG 9859
GAAGGACTTAAATGACTCACTTAAAG 13000 4
GCAAAGTGAGTCCCAGGACAGCCAGG 13000 3
GGAAGGGTGAAAGAGGAAGAGAAGGA 13000 1 mmu_ref_1_37:184288690 R TCCTTCTCTTCCTCTTTCACCCTTCC 10906
GTCAGATATTCTATATAATGAAAGAA 13000 1 mmu_ref_13_37:40107677 R TTCTTTCATTATATAGAATATCTGAC 9859
GGTATCAAGAGTTAAAGTTTTATGTA 13000 5
TTTCTCTCTCTCTCTCCACTTCTCTG 13000 1 mmu_ref_13_37:118278073 R CAGAGAAGTGGAGAGAGAGAGAGAAA 10906
GGACCTGGAATATGGCGAGAAAACTG 13000 48
GTCCTACAGGGGACATTTCTAAATTT 11953 62
TGTATGACATGAAATATGGCAAGAAA 11953 10
TAGTAAAGTTTCTTTTATGAATGTGG 13000 255
GTTCCTTTGTACATTAATGGTCATAG 13000 1 mmu_ref_3_37:25517235 R CTATGACCATTAATGTACAAAGGAAC 9859
TACAATGGTCACTAATCATTCTTAAC 0 0
TCAATAAGTAGTAACGGACAGGTGGA 13000 1 mmu_ref_11_37:88900847 F TCAATAAGTAGTAACGGACAGGTGGA 9859
GGAGAAAGTTTATGTTGAGACATTTT 13000 1 mmu_ref_14_37:60444247 F GGAGAAAGTTTATGTTGAGACATTTT 9859
GTGTATATCAATGAGTTACAATGAAA 13000 2
GTGTACTAGAACATTAGCATTTCAAG 13000 1 mmu_ref_9_37:39813035 F GTGTACTAGAACATTAGCATTTCAAG 9859
GAGAAATACACACTTTAGGACGTGAA 13000 49
GTGATTTTCAGTTCTCTCGCCATATT 11953 44
GTGGTTTTTATCATTTTCCATGTTTC 13000 5
GGACTAATAGCCACTTATCAGTGAGT 13000 8
GACACCTGGACAGATTAGATATTATT 0 0
TAAAATTATTGTTCTGGAACGAAAAG 13000 1 mmu_ref_8_37:35218943 F TAAAATTATTGTTCTGGAACGAAAAG 9859
TGGAGAAGTTCTATGTTCCTAAAGGA 13000 1 mmu_ref_2_37:144191295 R TCCTTTAGGAACATAGAACTTCTCCA 10906
GTATATGAACATGTCTACATGTTTGA 13000 1 mmu_ref_1_37:173724022 F GTATATGAACATGTCTACATGTTTGA 9859
GGTGTGGGTGGGTTGTTGTTGGTGGG 13000 1 mmu_ref_12_37:8688329 F GGTGTGGGTGGGTTGTTGTTGGTGGG 10906
GAAACACTGGCAGGTTAACCACAGTC 11953 1 mmu_ref_12_37:119479603 R GACTGTGGTTAAACTGCCAGTGTTTC 10906
GTGGAAAATTTAGAAATGTCCACTGT 13000 50
GTCTCATTCATTTATCCTCAGAGAAG 13000 1 mmu_ref_13_37:89183794 R CTTCTCTGAGGATAAATGAATGAGAC 9859
GATAGCTAAAGCTGAAGTTAGTTAAG 13000 1 mmu_ref_6_37:54554544 F GATAGCTAAAGCTGAAGTTAGTTAAG 9859
GTAAGCAGTATCTGGGTAGCAGTGAT 13000 1 mmu_ref_4_37:30409546 R ATCACTGCTACCCAGATACTGCTTAC 9859
GTTTTGTCGATTTTATTCTTTCCAGG 13000 1 mmu_ref_3_37:112008324 F GTTTTGTCGATTTTATTCTTTCCAGG 9859
TTAATTCCTCTTACTCAGGAAGCAAA 13000 1 mmu_ref_8_37:108643109 F TTAATTCCTCTTACTCAGGAAGCAAA 9859
GTTTGGGAAATTGGATTTTGTTTCGT 10906 1 mmu_ref_7_37:146810559 F GTTTGGGAAATTGGATTTTGTTTGGC 9859
GATAATTCCACATGCATATGTCACAT 13000 1 mmu_ref_9_37:17363912 F GATAATTCCACATGCATATGTCACAT 9859
GAAAAATGAAATCACTTGAATGATGG 13000 1 mmu_ref_4_37:19271012 R CCATCATTCAAGTGATTTCATTTTTC 9859
GTCTCCATCTAGGATACTGTAGGGAT 13000 1 mmu_ref_14_37:47151876 R ATCCCTACAGTATCCTAGATGGAGAC 9859
GGAAAACACGGAGCTAAGGACGGAAT 11953 1 mmu_ref_3_37:145805803 F GGAAAACACGGAGCTAAGGACGGTAT 9859
GTATGATAAAAACTTCAAATCTCTGA 13000 255
GAGGGATGGATGCTATGCTCACTTAT 13000 1 mmu_ref_2_37:136005373 F GAGGGATGGATGCTATGCTCACTTAT 9859
GTGATTTTCAGTTTTCTCGCCATATT 13000 44
GAATCCGGTTAAAGTTGGCAGTTGGT 0 0
GTGGATAATTTAGAAATGTCCACTGT 11953 51
GTCTGCTATCCCTTCCTTCTCTTCCC 13000 1 mmu_ref_1_37:22573779 R GGGAAGAGAAGGAAGGGATAGCAGAC 9859
GAAAAAATATCAAGTGATCAAGTACA 13000 1 mmu_ref_2_37:86868605 F GAAAAAATATCAAGTGATCAAGTACA 9859
GATGTTTCTCATTTTCCATGATTTTC 13000 71
TTCAACATAGTTGTTGAATTGGTGGT 13000 1 mmu_ref_5_37:148339512 F TTCAACATAGTTGTTGAATTGGTGGT 9859
GATATGCGCTTACCCTGCTAGAAGGG 13000 1 mmu_ref_5_37:76436477 R CCCTTCTAGCAGGGTAAGCGCATATC 9859
GTAGAATTTCTGCTCAGAATCCATTT 13000 1 mmu_ref_18_37:19741659 R AAATGGATTCTGAGCAGAAATTCTAC 9859
GTTAAAGCGCCGCAAGTGTTGATTTG 13000 1 mmu_ref_2_37:48411382 R CAAATCAACACTTGCGGCGCTTTAAC 9859
GTGCATTTTTCCTTCCTTCCATCACA 13000 1 mmu_ref_2_37:54382378 F GTGCATTTTTCCTTCCTTCCATCACA 9859
GTGGTTTTTATCATTTTCCATGTTTC 13000 5
GTGAAAAATGAGAAATGCACACTCTA 11953 90
TTTGAATGATTACTAAGGGAAGATTT 13000 1 mmu_ref_6_37:6065828 R AAATCTTCCCTTAGTAATCATTCAAA 9859
GTGTGTAAGGGTGTGGGGGGGATTGT 13000 1 mmu_ref_7_37:60884160 F GTGTGTAAGGGTGTGGGGGGGATTGT 10906
TCTCCAACTATAAATTCATGTTCCAG 11953 1 mmu_ref_3_37:92135783 F TCTCCAACTATAAATTAATGTTCCAG 9859
GGTTGCCAAAAATTATGCCTACAATT 13000 1 mmu_ref_X_37:22779882 R AATTGTAGGCATAATTTTTGGCAACC 10906
GTTTTCTCGCCATATTCCAGGTCCTT 13000 1 mmu_ref_2_37:98507289 R AAGGACCTGGAATATGGCGAGAAAAC 11953
GGAAAATGAGAAACATCCACTTGACG 13000 23
TTCCAAAGTGTGCTTGCAATATGACC 13000 1 mmu_ref_6_37:18221380 R GGTCATATTGCAAGCACACTTTGGAA 10906
GGAAGTTTCTCATATTCTTCGATTTT 0 0
AATCATGGAAAATGAGAAACATCCAC 13000 67
GAATATTTAGAAATGTCCACTGTAGG 13000 3
