Constructor Detail

• GeneChromosomePosition

  public GeneChromosomePosition()

Method Detail

• getGeneName

  public java.lang.String getGeneName()

• setGeneName

  public void setGeneName​(java.lang.String geneName)

• getGenebankId

  public java.lang.String getGenebankId()

• setGenebankId

  public void setGenebankId​(java.lang.String genebankId)

• getChromosome

  public java.lang.String getChromosome()

• setChromosome

  public void setChromosome​(java.lang.String chromosome)

• getOrientation

  public java.lang.Character getOrientation()

• setOrientation

  public void setOrientation​(java.lang.Character orientation)

• getTranscriptionStart

  public java.lang.Integer getTranscriptionStart()

• setTranscriptionStart

  public void setTranscriptionStart​(java.lang.Integer transcriptionStart)

• getTranscriptionEnd

  public java.lang.Integer getTranscriptionEnd()

• setTranscriptionEnd

  public void setTranscriptionEnd​(java.lang.Integer transcriptionEnd)

• getCdsStart

  public java.lang.Integer getCdsStart()

• setCdsStart

  public void setCdsStart​(java.lang.Integer cdsStart)

• getCdsEnd

  public java.lang.Integer getCdsEnd()

• setCdsEnd

  public void setCdsEnd​(java.lang.Integer cdsEnd)

• getExonCount

  public int getExonCount()

• setExonCount

  public void setExonCount​(int exonCount)

• getExonStarts

  public java.util.List<java.lang.Integer> getExonStarts()

• setExonStarts

  public void setExonStarts​(java.util.List<java.lang.Integer> exonStarts)

• getExonEnds

  public java.util.List<java.lang.Integer> getExonEnds()

• setExonEnds

  public void setExonEnds​(java.util.List<java.lang.Integer> exonEnds)

• compareTo

  public int compareTo​(GeneChromosomePosition o)

  Specified by:

  compareTo in interface java.lang.Comparable<GeneChromosomePosition>

• toString

  public java.lang.String toString()

  Overrides:

  toString in class java.lang.Object