Constructor Detail

• CoxVariables

  public CoxVariables​(java.lang.String cohortName,
                      java.lang.String geneSet,
                      java.lang.String genes)

  Parameters:

  cohortName -

  geneSet -

  genes -

Method Detail

• getUniqueID

  public int getUniqueID()

  Need a unique id from String

  Returns:

• putCoxInfo

  public void putCoxInfo​(java.lang.String name,
                         CoxInfo coxInfo)

  Parameters:

  name -

  coxInfo -

• getCoxInfo

  public CoxInfo getCoxInfo​(java.lang.String name)

  Parameters:

  name -

  Returns:

• encodeFileURL

  public java.lang.String encodeFileURL​(java.lang.String file)

  Parameters:

  file -

  Returns:

• fmt

  public static java.lang.String fmt​(java.lang.Double d,
                                     int precision,
                                     int pad)

  Parameters:

  d -

  precision -

  pad -

  Returns:

• toString

  public java.lang.String toString()

  Overrides:

  toString in class java.lang.Object

• getCohortName

  public java.lang.String getCohortName()

  Returns:

  the cohortName

• getGeneSet

  public java.lang.String getGeneSet()

  Returns:

  the geneSet

• getGenes

  public java.lang.String getGenes()

  Returns:

  the genes

• getCoxInfoHashMap

  public java.util.LinkedHashMap<java.lang.String,​CoxInfo> getCoxInfoHashMap()

  Returns:

  the coxInfoHashMap